 班級人數(shù)--熱線:4008699035 手機(jī):15921673576( 微信同號) |
| 增加互動(dòng)環(huán)節(jié)，
保障培訓(xùn)效果，堅(jiān)持小班授課，每個(gè)班級的人數(shù)限3到5人，超過限定人數(shù),安排到下一期進(jìn)行學(xué)習(xí)。 |
| 授課地點(diǎn)及時(shí)間 |
上課地點(diǎn)：【上海】：同濟(jì)大學(xué)(滬西)/新城金郡商務(wù)樓(11號線白銀路站) 【深圳分部】：電影大廈(地鐵一號線大劇院站)/深圳大學(xué)成教院 【北京分部】：北京中山學(xué)院/福鑫大樓 【南京分部】：金港大廈(和燕路) 【武漢分部】：佳源大廈（高新二路） 【成都分部】：領(lǐng)館區(qū)1號（中和大道） 【廣州分部】：廣糧大廈 【西安分部】：協(xié)同大廈 【沈陽分部】：沈陽理工大學(xué)/六宅臻品 【鄭州分部】：鄭州大學(xué)/錦華大廈 【石家莊分部】：河北科技大學(xué)/瑞景大廈
開班時(shí)間(連續(xù)班/晚班/周末班）：2020年3月16日 |
| 課時(shí) |
◆資深工程師授課
☆注重質(zhì)量
☆邊講邊練
☆若學(xué)員成績達(dá)到合格及以上水平，將獲得免費(fèi)推薦工作的機(jī)會(huì)
★查看實(shí)驗(yàn)設(shè)備詳情，請點(diǎn)擊此處★ |
| 質(zhì)量以及保障 |
☆
1、如有部分內(nèi)容理解不透或消化不好，可免費(fèi)在以后培訓(xùn)班中重聽；
☆ 2、在課程結(jié)束之后,授課老師會(huì)留給學(xué)員手機(jī)和E-mail,免費(fèi)提供半年的課程技術(shù)支持，以便保證培訓(xùn)后的繼續(xù)消化；
☆3、合格的學(xué)員可享受免費(fèi)推薦就業(yè)機(jī)會(huì)。
☆4、合格學(xué)員免費(fèi)頒發(fā)相關(guān)工程師等資格證書，提升您的職業(yè)資質(zhì)。 |
☆課程大綱☆ |
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- Geneious是一款綜合、跨平臺(tái)的生物信息學(xué)軟件，包括操作、發(fā)現(xiàn)、共享和探索生物數(shù)據(jù)，例如DNA序列或蛋白質(zhì)，系統(tǒng)進(jìn)化，三維結(jié)構(gòu)信息，出版文獻(xiàn)等。它的功能包括序列對比和系統(tǒng)學(xué)分析，毗連群，引物設(shè)計(jì)和克隆和限制性分析，使用NCBI和EMBL，BLAST，蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)查看，自動(dòng)化醫(yī)學(xué)搜索等。它甚至包含了一個(gè)API，您可以創(chuàng)建您的個(gè)人生物信息插件。
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- Geneious主要功能：
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- 1. NGS分析和基因組學(xué)
- 使用行業(yè)領(lǐng)先的算法，包括TopHat和Velvet，Illumina、PacBio或Torrent讀數(shù)（任何長度、成對端、條形碼）的從頭組裝或參考映射。對數(shù)據(jù)的綜合分析，包括基因組瀏覽器、持續(xù)的可視化、SNP調(diào)用和RNA-Seq表達(dá)式。
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- 2. 序列圖和色譜分析
- 修剪、組裝和查看Sanger排序跟蹤文件，正確的堿基調(diào)用并創(chuàng)建一致的序列?；蝾A(yù)測、模式、翻譯和變異調(diào)用的自動(dòng)標(biāo)注?；蛐臀⑿l(wèi)星跟蹤自動(dòng)梯擬合和峰值調(diào)用和生成等位基因表。
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- 3. 對齊和樹構(gòu)建
- 使用包括MAFFT和ClustalW在內(nèi)的可信算法對DNA或蛋白質(zhì)進(jìn)行成對和多種比對。查看和編輯實(shí)時(shí)翻譯和突出顯示。使用包括RAxML和PAUP在內(nèi)的同行評審算法構(gòu)建系統(tǒng)樹，并為公開準(zhǔn)備的圖形調(diào)整顯示設(shè)置。
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- 4. 分子克隆
- 查看質(zhì)粒圖，自動(dòng)注釋矢量并用注釋復(fù)制粘貼序列。尋找限制站點(diǎn)、消化、連接和執(zhí)行Golden Gate，Gibson和Gateway克隆。設(shè)計(jì)引物，找到CRISPR站點(diǎn)并優(yōu)化密碼。在克隆過程中跟蹤歷史和親子后代譜系。
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- 5. 搜索、共享和自動(dòng)化
- 針對NCBI進(jìn)行批量BLAST，并直接搜索GenBank。使用無縫集成的共享庫集中和協(xié)作數(shù)據(jù)。導(dǎo)入和導(dǎo)出大多數(shù)行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)文件格式。建立自動(dòng)化的工作流程，以提高效率，控制業(yè)務(wù)流程，并減少您的研究中的人為錯(cuò)誤。
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- 6. SnapGene文件導(dǎo)入
- 將SnapGene*.gna序列文件拖放到Geneious中，無縫地導(dǎo)入序列及其注釋和其他元數(shù)據(jù)。
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- 7. CRISPR-CPF1特異性評分
- 自信地選擇理想的CRISPR-CPF1引導(dǎo)RNA位點(diǎn)使用新的特異性評分，這是根據(jù)對您選擇的數(shù)據(jù)庫的非目標(biāo)分析計(jì)算出來的。
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- 8. 智能NGS導(dǎo)入
- 只需一個(gè)簡單的步驟就可以將任何類型的SAM、GFF、BED和VCF文件拖放到Geneious中，即使您有不同的樣品和參考序列的混合物。
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- 9. CRISPR Cpf1選項(xiàng)
- 添加了CRISPR-CPF1與5' PAM位點(diǎn)的支持。在A和T豐富序列中找到位點(diǎn)，并在體內(nèi)具有更高的裂解效率。
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- 10. RNA-Seq表達(dá)分析的火山圖
- 在交互式火山圖中可視化基因表達(dá)，可以用來突出和跳轉(zhuǎn)到差異表達(dá)基因。
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- 11. 限制性位點(diǎn)無表型突變分析
- 自動(dòng)識(shí)別在不影響蛋白質(zhì)的情況下引入限制位點(diǎn)的編碼序列中的點(diǎn)突變。
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- 12. 漂亮的PCA圖
- 具有更好的標(biāo)簽和新的可視化選項(xiàng)，創(chuàng)建漂亮的PCA圖形。
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- 13. 創(chuàng)建酶制劑
- 不再從其他來源獲取信息?，F(xiàn)在您可以很容易地創(chuàng)建您自己的酶組。
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- 14. 更好的FASTQ導(dǎo)入功能
- 在導(dǎo)入過程中，成對讀取可以相互關(guān)聯(lián)，而Geneious會(huì)猜出它們是如何配對的。還可以設(shè)置讀取技術(shù)。
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- 15. 為細(xì)菌基因組比對更新Mauve插件
- 現(xiàn)在包括對序列列表的支持和用于重新排序重疊群的MCM操作，使draft基因組對齊和進(jìn)行基因組整理成為可能。
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- 16. 更好的BLAST服務(wù)器管理
- 一次設(shè)置多個(gè)BLAST服務(wù)器鏡像，每次搜索時(shí)，選擇優(yōu)秀的一個(gè)。不用每次切換鏡像。
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- 17. NCBI BLAST云支持
- 有了NCBI BLAST云之后，設(shè)置您自己的BLAST鏡像變得更為簡單。如果您以這種方式創(chuàng)建一個(gè)鏡像，Geneious可以與它連接起來。
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- 18. 按索引連接
- 連接序列列表并按索引對齊，而不是按照名稱對齊，這對于合并不完全重疊的成對讀取非常有用。
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- 19. 序列列表的CSV/TSV導(dǎo)出
- 將序列表中的所有序列連同它們的元數(shù)據(jù)一起導(dǎo)出到CSV/TSV中，這樣您就可以將它們放在Excel中或類似的情況下進(jìn)行進(jìn)一步的分析。
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- What's New in Geneious Prime 2019？
- The Geneious Prime 2019 release is here. Geneious Prime 2019 is free if you have a valid subscription or a perpetual version Prime 2019 license. If you are currently using a previous version-only licence (eg R11), you will have to purchase an upgrade.
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- We have changed the way we refer to the new versions of Geneious with this release being called Geneious Prime 2019 instead of Geneious R12. This will make it easier for you to know that you are on the latest version. Please visit Geneious Prime for further details of the recent name change.
- Have an older version of Geneious Prime? The software that you know and love gets better every year. Upgrade now and you can enjoy Geneious Prime 2019 as well as all the features included in previous releases.
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- Geneious Prime 2019 Festures and Benefits:
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- Custom Codon Usage Tables
- Back translate and optimize codons using your own codon usage tables. Import standard formats from public databases or external codon analysis tools.
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- Rapid Manual Primer Design
- Select desired binding site in the Sequence View to see real-time display of length and melting point (Tm）then easily add a primer annotation with a convenient new button.
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- Powerful Primer Annotation Display
- 5' extensions (tails) on annotated primers are now displayed inside the sequence view to indicate the length of the extension, the nucleotides it contains and what functional elements are present such as restriction sites, spacers and tags.
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- Simplified Testing and Annotation of Existing Primers
- Easily search all folders for primers that match a sequence of interest with the redesigned "Test with Saved Primers" operation. Copy and paste primers from other programs into the new "Add Primers" operation to find them on your target sequence in one step.
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- Drag and Drop Sequence Export
- Export annotated sequences in GenBank format by simply dragging documents out of Geneious Prime and onto the desktop or into another program.
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- Easy Extraction of PCR and Restriction Digest Products
- Shift click between two compatible primers or restriction enzymes for quick and easy extraction of their product from your sequence.
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- Improved Protein Statistics
- Calculate on the fly statistics for protein sequences directly on nucleotide sequences within the Statistics panel, with new protein statistics added including charge at pH 7 and amino acid group counts.
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- Improved GenBank Export
- Export the information you need with your sequences using the simplified, flexible options to include your own Meta-Data fields and allow or constrain export parameters to suit downstream applications.
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- Publish Plugins via Internal Network
- Create a curated list of plugins to offer privately to members of your organization via your internal network.
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- Usability Tweaks to Increase Efficiency
- Enjoy an improved table of primers, drag and drop backbone selection for cloning, easier workflow management, better defaults, a less cluttered Sequence View and many other little tweaks and improvements.
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